Война

В 1992-1993 годах, после объявления Боснией и Герцеговиной своей независимости от Югославии город подвергся девятимесячной осаде.

3 апреля 1992 Мостар подвергся бомбардировке со стороны Югославской Народной Армии (ЮНА). Затем, в течение недели, ЮНА постепенно захватила контроль над большей частью города. 8 апреля герцеговинские хорваты образовали Хорватский Оборонительный Совет ("Хорватско Вече Обране" - ХВО), который вступил в бой с силам ЮНА. Огнём ЮНА было повреждено и разрушено множество гражданских объектов. Среди них оказались францисканский монастырь, католический собор, епископский дворец с библиотекой из 50000 книг, а так же 14 мечетей.

12 июня военные силы ХВО накопили достаточно вооружения и людей, чтобы вытеснить войска ЮНА из Мостара. 4-й Корпус армии Боснии и Герцеговины, основное военное объединение боснийцев, было основано в тот же год в Мостаре.

В 1993 боснийские хорваты и боснийцы начали длительную борьбу за контроль над Мостаром. 9-го мая боснийские хорваты начали наступление, во время которого они безжалостно бомбили боснийскую часть города, превращая её в руины. Разрушению подверглись множество мечетей и зданий оттоманской эпохи. В течение конфликта хорваты устроили концлагерь для мусульман на мостарском вертолётном аэродроме.

9 ноября боснийские хорваты выстрелом из миномёта разрушили Старый Мост.

Соглашение о прекращении огня было подписано 25 февраля 1994 года. Город остался разделённым между двумя враждебными пратиями. Некоторая стабильность наступила в 1994, после пересмотрения границ, а полное восстановление свободного перемещения между двумя частями города произошло в 1996.